BCG vakcina se prima na rodjenju u jednoj dozi.Na mestu davanja pojavi se promena hipersenzitivnost za oko desetak dana mali otok-mehurić, koju ne treba dirati niti zalepiti.Stvaranje otoka sa kazeoznim sadržajem, specifičnom tkivnom reakcijom beličastog-sirastog izgleda, meke konzistencije.U jednom momentu sam od sebe pukne i sadržaj iscuri napolje.Taj proces može da se ponovi više puta i na kraju ostaje ožiljak.To je znak da se vakcina primila i dete je zaštićeno, od tuberkuloze.Redje ali može nastati prava komplikacija, ako se naprave greške u vakcinaciji, koje mogu biti: lokalne, regionalne i udaljene.
Lokalne komplikacije nastaju prilikom dubljeg ubrizgavanja BCG vakcine tzv.hladan apsces, koji se stvara posle davanja u roku od 6-8 nedelja i traje do 6 meseci.Kod lokalne komplikacije mogu da se pridruže i sekundarne infekcije (stafilokokne, streptokokne), koje prate faze ulceracije ili kao reakcija javlja se keloidni ožiljak kože.
U regionalne komplikacije javljaju se kolikviranih i fistulizovanih regionalnih limfnih žlezda.Kod ove vrste komplikacije BCG vakcina aplikuje se pogrešno supkutano (potkožno) u većoj dozi.Bacil veoma brzo i lako se širi i prenosi se do regionalnih limfnih žlezda.
Udaljene komplikacije mogu se javiti kod osoba koji se nalaze u prealergijskoj fazi usled spontane infekcije.To su erythema nodosum, besegit, BCG osteitis koji se širi hematogeno nastaje na rebrima.Mogu se manifestovati u vidu kliničkog simptoma kao osip, piodermija, pneumonija.